Przeszłość rodów Hikari i Niwa opowiedziana ustami Hiwatariego... Zagadka wielkiego włamywacza Darka zostaje wyjaśniona... Poznawszy przeznaczenie Hiwatariego, Daisuke, z nowym postanowieniem w sercu, walczy z Argentine! Jak potoczy się pojedynek Darka i Argentine...!?
"Kocham Darka.." - Daisuke dostaje kosza od swojej pierwszej miłości Risy i pod wpływem nadmiernego szoku pozwala, by Dark przejął jego ciało! Ten z nowej postaci zaczyna rozrabiać..!! Oto DNAngel 3 wyczekiwany kolejny tom romantycznej komedii!!
Daisuke zostaje pochwycony przez pozornie martwe dzieło sztuki "Wskazówkę czasu"! Wygląda na to, że jego pieczęć przełamał namalowany przez Daisuke i podarowany Riku obraz przedstawiający zimowy krajobraz. Aby ratować Daisuke Dark zamierza odzyskać go od Riku, ale... natrafia na zagadke rodów Niwa
